Informe de análisis del tamaño, la participación y las tendencias del mercado global de metagenómica basada en secuenciación: descripción general del sector y pronóstico hasta 2033

Tamaño del mercado de la metagenómica impulsada por secuenciación

• El tamaño del mercado global de metagenómica impulsada por secuenciación se valoró en USD 346,08 millones en 2025  y se espera que alcance  los USD 599,99 millones para 2033 , con una CAGR del 7,12 % durante el período de pronóstico.
• El crecimiento del mercado está impulsado principalmente por los avances en tecnologías de secuenciación de alto rendimiento, herramientas bioinformáticas y la disminución de los costos de secuenciación, que permiten un análisis integral de las comunidades microbianas en diversos entornos.
• Además, el aumento de las aplicaciones en la salud, la agricultura, la monitorización ambiental y la biotecnología, junto con la creciente demanda de medicina personalizada y soluciones basadas en microbios, están posicionando la metagenómica basada en secuenciación como una herramienta crucial para la investigación y las aplicaciones industriales. Estos factores combinados están acelerando su adopción en el mercado, impulsando así significativamente el crecimiento de la industria.

Análisis del mercado de la metagenómica basada en secuenciación

• La metagenómica impulsada por secuenciación, que permite un análisis integral de las comunidades microbianas mediante secuenciación de alto rendimiento y bioinformática, es cada vez más fundamental para aplicaciones en atención médica, agricultura, monitoreo ambiental y biotecnología industrial debido a su precisión, escalabilidad y capacidad para descubrir nuevas funciones microbianas.
• La creciente demanda de metagenómica impulsada por secuenciación se ve impulsada principalmente por los avances en las tecnologías de secuenciación de próxima generación, la disminución de los costos de secuenciación y la creciente necesidad de conocimientos basados ​​en datos sobre los microbiomas para la medicina personalizada, el diagnóstico de enfermedades y las soluciones basadas en microbios.
• América del Norte dominó el mercado de metagenómica impulsado por secuenciación con la mayor participación en los ingresos del 39,8 % en 2025, caracterizada por una fuerte presencia de importantes proveedores de tecnología de secuenciación, una infraestructura de investigación bien establecida e importantes inversiones gubernamentales y privadas en investigación genómica y de microbiomas, particularmente en los EE. UU., donde los sectores de la salud y la biotecnología están impulsando una amplia adopción.
• Se espera que Asia-Pacífico sea la región de más rápido crecimiento en el mercado de metagenómica impulsada por secuenciación durante el período de pronóstico debido al aumento de las inversiones en investigación, la expansión del sector de biotecnología y la creciente adopción de tecnologías de secuenciación avanzadas en países como China, India y Japón.
• El segmento de kits y reactivos dominó el mercado de metagenómica impulsada por secuenciación con una participación de mercado del 38,9 % en 2025, respaldado por su papel esencial en la preparación de muestras, la construcción de bibliotecas y la extracción de ADN/ARN microbiano, con un uso creciente en laboratorios de investigación, empresas de biotecnología e institutos académicos debido a la demanda recurrente y los rápidos avances en la química de secuenciación.

Alcance del informe y segmentación del mercado de metagenómica basada en secuenciación 

Tendencias del mercado de la metagenómica impulsada por la secuenciación

Integración de IA y bioinformática avanzada para el conocimiento del microbioma

• Una tendencia significativa y en auge en el mercado global de la metagenómica basada en secuenciación es la creciente integración de la inteligencia artificial (IA) y las plataformas bioinformáticas avanzadas para analizar datos microbianos complejos con mayor eficiencia y precisión. Esta fusión de tecnologías está mejorando el conocimiento sobre la composición, la función y las interacciones microbianas.
  • Por ejemplo, plataformas como CosmosID y One Codex utilizan algoritmos impulsados ​​por IA para proporcionar una identificación rápida de patógenos y perfiles funcionales de microbiomas, lo que permite a los investigadores obtener información útil a partir de grandes conjuntos de datos.
• La integración de IA permite el modelado predictivo del comportamiento de la comunidad microbiana y facilita la detección de anomalías en muestras clínicas, ambientales e industriales. Algunas plataformas pueden sugerir dianas microbianas para terapias o biorremediación basándose en los resultados de la secuenciación.
• La integración perfecta de datos de secuenciación con soluciones bioinformáticas basadas en la nube permite la gestión centralizada de conjuntos de datos multiómicos, lo que permite a los investigadores analizar, visualizar e interpretar resultados en múltiples proyectos desde una única interfaz.
• Esta tendencia hacia análisis metagenómicos más inteligentes, automatizados y escalables está redefiniendo las expectativas para la investigación y las aplicaciones industriales. Empresas como QIAGEN e Illumina están desarrollando plataformas con interpretación de datos basada en IA, flujos de trabajo automatizados y capacidades de generación de informes en tiempo real.
• La demanda de soluciones metagenómicas impulsadas por secuenciación que ofrecen integración de IA y análisis avanzados está creciendo rápidamente en los sectores de la salud, la agricultura y el medio ambiente, a medida que las organizaciones priorizan cada vez más la precisión, la escalabilidad y los conocimientos prácticos.
• La creciente colaboración entre los proveedores de tecnología de secuenciación y las empresas de análisis en la nube está permitiendo la investigación colaborativa en tiempo real en diferentes geografías, acelerando los descubrimientos en terapias basadas en el microbioma y aplicaciones industriales.

Dinámica del mercado de la metagenómica impulsada por la secuenciación

Conductor

Creciente demanda de investigación basada en el microbioma y medicina personalizada

• El enfoque creciente en la investigación del microbioma, junto con la creciente adopción de la medicina personalizada, es un impulsor importante para el crecimiento de las soluciones metagenómicas impulsadas por la secuenciación.
  • Por ejemplo, en marzo de 2025, Diversigen lanzó un servicio integral de elaboración de perfiles de microbioma dirigido a aplicaciones de medicina de precisión, que se espera que acelere la adopción en el mercado.
• A medida que los sectores de la atención médica, la agricultura y la biotecnología dependen cada vez más de los conocimientos microbianos, la metagenómica impulsada por secuenciación permite la identificación de marcadores de enfermedades, candidatos probióticos y enzimas nuevas, lo que proporciona una propuesta de valor convincente frente a los métodos de microbiología tradicionales.
• Además, la necesidad de un análisis rápido y de alta resolución de comunidades microbianas complejas está impulsando inversiones en plataformas de secuenciación y bioinformática de próxima generación capaces de manejar conjuntos de datos a gran escala de manera eficiente.
• La escalabilidad de los servicios de secuenciación, combinada con la disminución de los costos de secuenciación y la expansión de la financiación de la investigación, está facilitando una adopción más amplia tanto en entornos académicos como industriales.
• La integración de datos de secuenciación con iniciativas de medicina de precisión, programas de optimización agrícola y aplicaciones de microbioma industrial es un factor clave que impulsa la adopción de soluciones metagenómicas a nivel mundial.
  • Por ejemplo, la creciente tendencia de la investigación sobre probióticos y terapias basadas en el microbioma en Asia-Pacífico está creando nuevas oportunidades de mercado para los servicios de secuenciación.
• La colaboración entre empresas farmacéuticas y proveedores de secuenciación para desarrollar tratamientos específicos basados ​​en el microbioma está impulsando la demanda de soluciones metagenómicas especializadas.

Restricción/Desafío

Complejidad de datos y barreras de estandarización

• El enorme volumen y la complejidad de los datos de secuenciación metagenómica plantean desafíos importantes para el procesamiento, la interpretación y el almacenamiento de datos, lo que puede obstaculizar su adopción en el mercado.
  • Por ejemplo, las inconsistencias en la preparación de muestras, los protocolos de secuenciación y los procesos bioinformáticos en los laboratorios pueden generar variabilidad en los resultados del perfil microbiano, lo que afecta la reproducibilidad y la confiabilidad.
• Los altos requisitos de recursos computacionales, las habilidades analíticas sofisticadas y la necesidad de una infraestructura robusta en la nube o local hacen que sea un desafío para las organizaciones de investigación más pequeñas o las empresas emergentes adoptar soluciones metagenómicas impulsadas por secuenciación.
• Si bien plataformas como Illumina BaseSpace y MG-RAST ofrecen procesos estandarizados, la falta de pautas universales y marcos regulatorios para el análisis metagenómico clínico e industrial sigue siendo una barrera.
• El costo relativamente alto de la secuenciación integral y el análisis de datos, especialmente para estudios longitudinales o a gran escala, puede limitar su adopción en regiones con recursos limitados o para organizaciones con presupuestos limitados.
• Superar estos desafíos a través de protocolos estandarizados, plataformas analíticas fáciles de usar y soluciones de secuenciación rentables será vital para el crecimiento sostenido en el mercado de la metagenómica impulsada por la secuenciación.
  • Por ejemplo, las preocupaciones sobre la privacidad de los datos y el cumplimiento en las aplicaciones clínicas pueden retrasar la adopción debido a consideraciones regulatorias y éticas en torno a los datos del microbioma humano.
• La falta de interoperabilidad entre diferentes plataformas de secuenciación y software bioinformático puede generar ineficiencias en el flujo de trabajo y retrasos en el análisis, lo que plantea un desafío adicional para la implementación generalizada.

Alcance del mercado de la metagenómica impulsada por secuenciación

El mercado está segmentado en función del producto, la aplicación y los usuarios finales.

• Por producto

En función del producto, el mercado de la metagenómica basada en secuenciación se segmenta en kits y reactivos, servicios de secuenciación y análisis de datos, instrumentos, consumibles y otros. El segmento de Kits y Reactivos dominó el mercado con la mayor participación en los ingresos, con un 38,9 % en 2025, gracias a su papel esencial en la preparación de muestras, la extracción de ADN/ARN microbiano y los flujos de trabajo de construcción de bibliotecas. La naturaleza recurrente del consumo de reactivos crea un ciclo de demanda continuo, lo que la convierte en la categoría con mayor generación de ingresos en laboratorios e institutos de investigación. Los crecientes avances en la química de secuenciación, como la fragmentación enzimática mejorada y los kits de amplificación de alto rendimiento, refuerzan aún más el dominio de este segmento. Su amplia adopción en aplicaciones metagenómicas ambientales, clínicas, agrícolas e industriales también contribuye significativamente a la estabilidad de los ingresos. Además, la creciente necesidad de kits estandarizados y de alta calidad para facilitar la integración multiómica continúa impulsando el crecimiento del segmento a nivel mundial.

Se prevé que el segmento de Servicios de Secuenciación y Análisis de Datos experimente el mayor crecimiento entre 2026 y 2033, impulsado por la creciente transición de los laboratorios hacia la secuenciación y la bioinformática externalizadas debido a los elevados costes de los instrumentos y la complejidad del análisis de datos. La creciente adopción de procesos de metagenómica basados ​​en la nube y la elaboración de perfiles microbianos optimizados mediante IA acelera la demanda de soluciones basadas en servicios. Por ejemplo, muchos grupos de investigación prefieren proveedores de servicios para la secuenciación shotgun, el análisis de variantes y la anotación funcional debido a los plazos de entrega más rápidos y al acceso a bioinformáticos expertos. La expansión de las bases de datos de referencia microbiana y las herramientas de aprendizaje automático para la identificación de patógenos está impulsando aún más la adopción de servicios. Se espera que el creciente uso de servicios de secuenciación en la toma de decisiones clínicas, la vigilancia ambiental y la agricultura impulse el rápido crecimiento de este segmento.

• Por aplicación

Según su aplicación, el mercado de la metagenómica basada en secuenciación se segmenta en medio ambiente, salud humana, agricultura, biotecnología, biocombustibles y otros. El segmento ambiental dominó el mercado en 2025, impulsado por la creciente necesidad de análisis de comunidades microbianas en suelos, agua, aguas residuales y ecosistemas marinos. Gobiernos e instituciones académicas integran cada vez más la metagenómica para la conservación de la biodiversidad, el monitoreo de la contaminación y el seguimiento de la resistencia a los antimicrobianos (RAM). La capacidad de la metagenómica basada en secuenciación para descubrir nuevos organismos y genes funcionales la hace indispensable para estudios ecológicos y climáticos. Los proyectos a gran escala sobre microbiomas ambientales y las iniciativas globales de muestreo de océanos continúan impulsando la demanda. El creciente enfoque en la biorremediación, la resiliencia climática y la restauración de ecosistemas consolida aún más el dominio de este segmento.

Se prevé que el segmento de Salud Humana experimente el mayor crecimiento entre 2026 y 2033, impulsado por el creciente papel de la metagenómica en el diagnóstico de enfermedades infecciosas, la terapéutica basada en el microbioma y la medicina personalizada. La secuenciación metagenómica se utiliza cada vez más para la detección rápida de patógenos en entornos clínicos, especialmente cuando los métodos de cultivo tradicionales fallan. Las crecientes inversiones en la investigación del microbioma intestinal están acelerando el desarrollo de aplicaciones para enfermedades metabólicas, neurológicas e inmunitarias. El auge de los probióticos de precisión, los biomarcadores microbianos y el análisis de la microbiota fecal también está impulsando su adopción. Además, los hospitales y laboratorios de diagnóstico están integrando la metagenómica basada en secuenciación en la vigilancia de brotes y la elaboración de perfiles de resistencia a los antimicrobianos, lo que está impulsando su rápido crecimiento.

• Por los usuarios finales

En función de los usuarios finales, el mercado de la metagenómica basada en secuenciación se segmenta en industrias farmacéuticas, empresas de biotecnología, laboratorios de investigación, laboratorios de patología, institutos académicos y de investigación, entre otros. El segmento de institutos académicos y de investigación dominó el mercado en 2025, gracias a una amplia financiación gubernamental, sólidos programas de secuenciación universitarios e iniciativas globales en curso sobre microbiomas. Estos institutos son los principales usuarios de la secuenciación de alto rendimiento para estudiar la ecología microbiana, los microbiomas humanos, la microbiota agrícola y las cepas microbianas industriales. La amplia adopción de la metagenómica en la investigación fundamental —como el descubrimiento de nuevas enzimas, genes de resistencia a antibióticos y vías metabólicas— refuerza el liderazgo de este segmento. Las universidades de todo el mundo están ampliando sus centros de secuenciación y bioinformática, lo que refuerza aún más su cuota de mercado dominante. Su papel en la publicación de investigaciones de alto impacto y el desarrollo de nuevas metodologías sigue impulsando el crecimiento del segmento.

Se proyecta que el segmento de Empresas Biotecnológicas crecerá a la tasa de crecimiento anual compuesta (TCAC) más rápida entre 2026 y 2033, impulsado por la creciente adopción de la metagenómica para la ingeniería microbiana, la biología sintética, el descubrimiento de enzimas y el desarrollo de bioproductos. Las empresas están aprovechando los conocimientos metagenómicos para desarrollar probióticos, biofertilizantes, productos químicos de origen biológico y nuevas terapias derivadas de genomas microbianos. La creciente comercialización de diagnósticos y terapias basados ​​en el microbioma también está acelerando la demanda del sector. Las empresas biotecnológicas están invirtiendo en flujos de trabajo de secuenciación automatizados, bioinformática basada en IA y plataformas de optimización de cepas para acelerar la innovación. Se espera que el creciente uso de la metagenómica en la biotecnología industrial, el bioprocesamiento ambiental y la agricultura de precisión impulse aún más el rápido crecimiento de este segmento.

Análisis regional del mercado de la metagenómica basada en secuenciación

• América del Norte dominó el mercado de metagenómica impulsado por secuenciación con la mayor participación en los ingresos del 39,8 % en 2025, caracterizada por una fuerte presencia de importantes proveedores de tecnología de secuenciación, una infraestructura de investigación bien establecida e importantes inversiones gubernamentales y privadas en investigación genómica y de microbiomas, particularmente en los EE. UU., donde los sectores de la salud y la biotecnología están impulsando una amplia adopción.
• Las instituciones de investigación, las compañías farmacéuticas y las empresas de biotecnología de la región valoran mucho la precisión, la escalabilidad y los conocimientos integrales que ofrecen las soluciones metagenómicas basadas en secuenciación para aplicaciones de atención médica, agricultura e industriales.
• Esta adopción generalizada está respaldada además por una financiación gubernamental y privada sustancial, un ecosistema genómico bien establecido y la presencia de proveedores líderes de tecnología de secuenciación, lo que establece a América del Norte como un centro para la investigación metagenómica tanto académica como comercial.

Perspectiva del mercado estadounidense de metagenómica impulsada por secuenciación

El mercado estadounidense de metagenómica, impulsado por la secuenciación, captó la mayor cuota de ingresos, con un 42%, en 2025, impulsado por importantes inversiones en investigación genómica, medicina de precisión y estudios del microbioma. Investigadores y empresas biotecnológicas priorizan cada vez más el análisis microbiano de alta resolución para impulsar las aplicaciones terapéuticas, diagnósticas y agrícolas. La creciente adopción de plataformas de secuenciación de última generación, combinada con bioinformática avanzada y análisis de datos en la nube, impulsa aún más el mercado. Además, las colaboraciones entre compañías farmacéuticas y proveedores de secuenciación para desarrollar tratamientos específicos basados ​​en el microbioma contribuyen significativamente a la expansión del mercado.

Perspectivas del mercado europeo de metagenómica basada en secuenciación

Se proyecta que el mercado europeo de metagenómica basada en secuenciación se expandirá a una tasa de crecimiento anual compuesta (TCAC) sustancial durante el período de pronóstico, impulsado por la sólida financiación gubernamental para la investigación del microbioma, marcos regulatorios rigurosos y la creciente demanda de medicina personalizada. La creciente urbanización y la adopción de tecnologías de secuenciación avanzadas están impulsando el crecimiento del mercado. Las instituciones de investigación y las empresas biotecnológicas europeas están aprovechando las soluciones metagenómicas para aplicaciones sanitarias, agrícolas y medioambientales, con una importante integración tanto en la investigación académica como en proyectos industriales.

Perspectivas del mercado de metagenómica impulsada por secuenciación en el Reino Unido

Se prevé que el mercado británico de metagenómica basada en secuenciación crezca a una tasa de crecimiento anual compuesta (TCAC) notable durante el período de pronóstico, impulsado por el creciente interés en las terapias basadas en el microbioma y las aplicaciones agrícolas. La creciente concienciación sobre la salud del microbioma y la alta adopción de soluciones de laboratorio digital están animando a las organizaciones de investigación, tanto académicas como industriales, a invertir en servicios de secuenciación. Se espera que el sólido ecosistema de investigación del Reino Unido, junto con la financiación pública y privada para iniciativas genómicas, continúe impulsando el crecimiento del mercado.

Perspectivas del mercado alemán de metagenómica basada en secuenciación

Se espera que el mercado alemán de metagenómica basada en secuenciación se expanda a una tasa de crecimiento anual compuesta (TCAC) considerable durante el período de pronóstico, impulsado por la creciente inversión en investigación biotecnológica, medicina de precisión y aplicaciones industriales para el microbioma. La infraestructura de investigación avanzada de Alemania y su enfoque en la innovación promueven la adopción de plataformas de secuenciación de alto rendimiento y soluciones bioinformáticas. La integración de la metagenómica basada en secuenciación con la automatización de laboratorios y las plataformas de análisis de datos es cada vez más frecuente, en consonancia con las prioridades de investigación de la industria y la academia locales.

Perspectivas del mercado de metagenómica impulsada por secuenciación en Asia-Pacífico

Se prevé que el mercado de metagenómica impulsado por secuenciación en Asia-Pacífico crezca a la tasa de crecimiento anual compuesta (TCAC) más alta, del 25 %, durante el período previsto de 2026 a 2033. Esto se debe al aumento de la inversión en I+D, la expansión de los sectores biotecnológico y farmacéutico, y la adopción de tecnologías de secuenciación avanzadas en países como China, Japón e India. Las iniciativas gubernamentales que apoyan la medicina de precisión, la investigación del microbioma y los laboratorios digitales están impulsando su adopción en el mercado. Además, la creciente presencia de proveedores de servicios de secuenciación y plataformas bioinformáticas en la región está aumentando la accesibilidad y la asequibilidad tanto para las instituciones de investigación como para las aplicaciones industriales.

Perspectivas del mercado de metagenómica impulsada por secuenciación en Japón

El mercado japonés de metagenómica, impulsado por la secuenciación, está cobrando impulso gracias al ecosistema de investigación avanzado del país, su cultura de alta tecnología y su énfasis en la medicina de precisión. Las instituciones de investigación y las empresas biotecnológicas japonesas priorizan el análisis microbiano integral para aplicaciones sanitarias, agrícolas e industriales. La integración de las tecnologías de secuenciación con la bioinformática en la nube y los sistemas de laboratorio automatizados está impulsando el crecimiento. Además, las colaboraciones entre empresas farmacéuticas y proveedores de secuenciación están impulsando la demanda de servicios especializados de metagenómica en los sectores de investigación residencial y comercial.

Perspectivas del mercado de metagenómica impulsada por secuenciación en India

El mercado indio de metagenómica, impulsado por la secuenciación, representó la mayor cuota de mercado en ingresos en Asia-Pacífico en 2025, gracias a la expansión del sector biotecnológico, el aumento de la inversión en I+D y la alta adopción de tecnologías de secuenciación avanzadas. India se está convirtiendo en un centro clave para la investigación del microbioma y las aplicaciones de la microbiología industrial. El impulso hacia la medicina de precisión, los servicios de secuenciación asequibles y la creciente colaboración entre proveedores de secuenciación nacionales e internacionales son factores clave que impulsan el mercado indio.

Cuota de mercado de la metagenómica impulsada por secuenciación

La industria de la metagenómica impulsada por secuenciación está liderada principalmente por empresas bien establecidas, entre las que se incluyen:

• Illumina, Inc. (EE. UU.)
• Thermo Fisher Scientific Inc. (EE. UU.)
• Oxford Nanopore Technologies plc (Reino Unido)
• Grupo BGI (China)
• QIAGEN (Países Bajos)
• Agilent Technologies, Inc. (EE. UU.)
• GENEWIZ (EE. UU.)
• Macrogen (Corea del Sur)
• Corporación Novogene (China)
• Zymo Research (EE. UU.)
• Diversigen (EE. UU.)
• Microsynth AG (Suiza)
• BaseClear (Países Bajos)
• MR DNA (EE. UU.)
• Eurofins Scientific (Luxemburgo)
• NuGEN Technologies (EE. UU.)
• Takara Bio (Japón)
• Swift Biosciences (EE. UU.)
• New England Biolabs (EE. UU.)
• CosmosID (EE. UU.)

¿Cuáles son los últimos avances en el mercado global de metagenómica impulsada por secuenciación?

• En junio de 2025, Phase Genomics lanzó sus nuevos paquetes ProxiMeta™ Starter y Elite, lo que hace que la metagenómica resuelta por genoma (Hi-C) sea mucho más accesible y ofrece flujos de trabajo de extremo a extremo que combinan secuenciación, bioinformática y soporte llave en mano para acelerar el análisis de la comunidad microbiana en entornos de investigación humana, ambiental y de salud pública.
• En abril de 2025, Metabolon, Inc. anunció el lanzamiento de una solución integral de investigación del microbioma que combina la secuenciación metagenómica, un nuevo panel de metabolitos del microbioma y herramientas bioinformáticas integradas que ofrecen a los investigadores una plataforma unificada para vincular datos genéticos microbianos con resultados metabólicos (fenotípicos) para obtener una comprensión más profunda de las comunidades microbianas.
• En febrero de 2025, MGI Tech Co., Ltd. lanzó su nuevo Paquete de secuenciación de metabarcoding de microbioma (MMSP), basado en sus plataformas DNBSEQ-G99 y DNBSEQ-E25, una solución optimizada que abarca la extracción de ácidos nucleicos, la preparación de bibliotecas, la secuenciación y el análisis, destinada a acelerar la investigación del microbioma en muestras humanas, ambientales, agrícolas e industriales.
• En abril de 2024, Clinical Microbiomics (tras su fusión con CosmosID) lanzó servicios avanzados de secuenciación de lectura larga que abarcan 16S, ITS, ARNr 18S, secuenciación genética personalizada y metagenómica completa, lo que permite una resolución y una calidad de ensamblaje sin precedentes para comunidades microbianas complejas y respalda la reconstrucción del genoma a nivel de cepa.
• En junio de 2022, Illumina, Inc. completó la adquisición de IDbyDNA, una empresa especializada en secuenciación metagenómica y bioinformática para la vigilancia de enfermedades infecciosas y patógenos, fortaleciendo las capacidades de Illumina en la detección de patógenos, la elaboración de perfiles de resistencia a los antimicrobianos y los flujos de trabajo de metagenómica clínica en todo el mundo.

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